魔法石被偷，邓布利多很快锁定了犯罪嫌疑人奇洛，将他抓住。
奇洛不承认，他磕磕巴巴地说自己被巨怪吓得晕倒了。
可是邓布利多使出了一个魔法，叫做“踪迹显影”，利用了一些炼金药粉，使时间回朔，证明奇洛确实趁着大家都在礼堂吃晚宴的时候，在地下室里放出巨怪制造混乱，也证明了他跑去偷了魔法石回到自己的房间。
邓布利多在他房间里使用“踪迹显影”，并没有显出伏地魔的影像，只看到“凯特尔伯恩”进门，跟一个看不见的敌人打斗，然后抢走了魔法石。
凯特尔伯恩大叫冤枉：“我一直在卫教授的办公室里喝茶聊天，我们讨论巨怪的事情直到你们来叫我，我绝对没有走出过卫教授办公室，卫教授可以为我作证！”
他急迫地看向卫骁，卫骁立即点头：“我可以为凯特尔伯恩教授作证，我们一直在一起。”
邓布利多冷着脸，蓝色的眼睛里闪烁着愤怒的光芒，“踪迹显影”并不能把过去的人完全清晰，分毫毕现地重新显现出来，只能看出来个大概，显示得最不清楚的就是魔法，他无法通过那个“凯塔尔伯恩”发射魔咒的性状判断是什么魔咒，只是觉得很陌生，脑海里没有这种魔咒的印象。
“不管怎么样，先把这个人交给魔法部吧。”
这是个尚有秩序的法制世界，邓布利多不能随便杀人，也不能任意审讯，只能提交证据给魔法部，让魔法部来处理。
邓布利多知道奇洛在不久前到阿尔及利亚旅行，自称遇到了吸血鬼，回来以后就神神叨叨，害怕吸血鬼突然出现吸他的血……奇洛本是个很优秀的拉文克劳学生，在霍格沃茨拉文克劳学院毕业，联想到伏地魔消失后在阿尔及利亚的传说，有理由怀疑，他是受了伏地魔蛊惑，来偷魔法石。
禁林里接连有独角兽死亡，独角兽的血有特殊的能力，很显然伏地魔在用独角兽的血续命，伏地魔指使奇洛盗取魔法石，是想要复活。
现在最要命的是：无法判断伏地魔是否已经拿到了魔法石。
邓布利多在接下来的时间里，把整个霍格沃茨都找遍了，也找不到伏地魔的踪迹。
现在大概率是伏地魔拿到了魔法石，抛弃了奇洛独自离开，用魔法石复活。
可假扮成凯特尔伯恩的那个人是谁呢？难道是伏地魔的后手？
邓布利多怀疑，城堡里面还有另外一个伏地魔的走狗，他替伏地魔在奇洛之后拿走了魔法石，奇洛就是个弃子，而那个人，才是真正被伏地魔所倚仗的人。
或许……我可以用时间转换器……
邓布利多从抽屉里取出一枚小小发亮的金计时器，有一条很长很精细的链子。
他拨动转换器，每转一次，时间可以倒退一小时……
时间，是最难掌握的魔法，魔法部对于时间转换器的使用制定了几百条法律，层层限制。
最常规的是，最多只能回到过去五个小时之内，一旦超出五个小时，就会造成不可预知的后果，而且不能被那个世界里的人看见，不能改变过去。
邓布利多法力深厚，又极有经验，他把时间调回到巨怪肆虐的时候，随着魔法启动，他感觉自己很快向后飞，眼前掠过各种模糊的云彩……
很快，他回到了自己用水牢把巨怪从礼堂里挪到户外的时间点，他来到卫骁办公室门口，等了好半天，也没有人出来，甚至连门都没有被打开，只是感觉到门前的灯光好像突然暗了一下，只有这一点异常……
蹲守无果，邓布利多回到正常时间，再次波动时间转换器，这次施用魔法走进墙壁上的一张画像里，蹲守在要赶往奇洛办公室的必经之路上。
他在墙上蹲守半天，除了奇洛，并没有看到其他人经过……
邓布利多多次使用时间转换器，不断回到过去，追查了好几天，也没查出来伪装成凯特尔伯恩拿走魔法石的是谁。
最后一次，他在奇洛离开房间以后，干脆直接闯了进去，正好遇上吸收魔法石能量的伏地魔。
伏地魔当年用“阿瓦达索命咒”杀死哈利波特的父母，被哈利波特的母亲牺牲自己，用最古老的守护咒反弹，把自己杀死，不过他有魂器保命，介乎于生死之间，苟延残喘。
不过他毕竟是最厉害的黑巫师，利用精神魔法，几句话就说服了奇洛，让他成为自己的手下。他想强大起来，于是让奇洛带他去禁林里面杀死独角兽，喝独角兽的血。
这回得了贤者之石的能量，他立刻强大起来……
邓布利多要用魔咒把魔法石召唤来，可是失效了，伏地魔把魔法石控制住，源源不断地从中吸收能量跟邓布利多斗法。
两人激烈的对抗，伏地魔是天才黑巫师，自己发明了很多堪称恐怖的黑魔法，邓布利多则被称为伟大的白巫师，两人都是最顶级的水平，虽然伏地魔现在无比虚弱，多打一会，肯定会被邓布利多收拾掉，可他吸收了贤者之石的能量，短时间的斗法，邓布利多也不能把他立即拿下。
两人只打了三招两式，强得能量波动就让邓布利多身上的时间转换器炸开……
邓布利多前后五次回来，相当于这个时间点内有六个邓布利多，一个在外面对付巨怪，一个变成画像挂在墙上，一个守在卫骁办公室门外，一个在这里跟伏地魔大战……
可怜的时间转换器终于不堪重负，崩裂破碎，时间的乱流把邓布利多带回他的办公室，重重跌落在椅子上，这也让他受了不轻的伤，浑身大汗淋漓，头痛欲裂！
他查不到更多的线索，只能确定伏地魔回来了，而且要窃取贤者之石。
伏地魔出现的消息，他没有告诉给魔法部，现任的部长康奈利·福吉是个软弱无能的政客。
福吉原来是魔法部事故灾害司的副司长，号称魔法部最不重要的司，他是在老巴蒂·克劳奇失去资格，邓布利多又拒绝出任的情况下，勉勉强强当上这个部长的。
他上任之后，手段圆滑，努力交好每一个看上去有用的人，当然也包括邓布利多。
但是邓布利多知道，如果告诉他伏地魔重新出现，福吉一定会百般否认，因为伏地魔是他解决不了的问题，到时候巫师界会集体动荡起来，人心惶惶，他这个部长也就干到头了。
最终给奇洛定下的罪名有两个，第一是盗窃罪，第二个是放出巨怪，意图制造灾难杀人。
魔法部法律执行司把他关进了巫师界的关塔那摩监狱——阿兹卡班！
奇洛不服，因为巨怪并没有造成哪怕一个人伤亡，再加上盗窃罪，并不足以让他进入阿兹卡班，可是魔法部认为，魔法石关系重大，邓布利多又说跟黑魔法，跟伏地魔有关，应该尽快处理，免得造成更坏的影响，于是从重处罚，还是把他关了进去。
卫骁感觉邓布利多开始怀疑自己，或者只是出于刚刚起疑心的阶段，但怀疑的种子一旦种下，就会在合适的时机生根发芽。
接下来的日子，他都老老实实地每天给学生们上课，努力做一名真正的魔法教师。